癌症的治疗和预后和癌症在哪一期密切相关。肛门癌的分期基于原发肿瘤的大小（用T来代表），是否有淋巴结转移（用N来代表）和远处转移（用M来代表）。肛门癌分为四期（I, II, III, IV），I期为早期癌，IV期为晚期扩散癌。

• Tis：原位癌；
• T1： 肿瘤小于2厘米；
• T2： 肿瘤大于2厘米但小于5厘米；
• T3： 肿瘤大于5厘米；
• T4： 肿瘤侵及邻近器官如阴道，尿道，膀胱。
   

• Nx：局部淋巴结转移未知；
• N0：无局部淋巴结转移；
• N1：有直肠周围淋巴结转移；
• N2：有同侧内髂骨或腹股沟淋巴结转移；
• N3：有直肠周围和腹股沟淋巴结转移，或双侧内髂骨或腹股沟淋巴结转移。

• M0：无远处转移；
• M1：有远处转移。

• I期：     T1N0M0；
• II期：    T2N0M0，T3N0M0；
• IIIA期：T1N1M0, T2N1M0, T3N1M0, T4N0M0；
• IIIB期：T4N1M0, 任何TN2M0, 任何TN3M0；
• IV期：   任何T任何NM1。

肛门癌的治疗已由过去的手术切除肛门发展为同时化放疗而保留肛门。

具体的化放疗方案为（1）：

氟尿嘧啶（5-FU）1000 mg/m2/天，持续静滴，第1～4 ，29～32天；
丝裂霉素（Mitomycin）10 mg/m2，静滴，第1和29天；
同步放疗到总剂量45 Gy。

较大的肛门癌或有淋巴结转移的肛门癌用以上的治疗方案不够理想。以下的同时化放疗效果较好（2）：

氟尿嘧啶（5-FU）200 mg/m2/天，持续静滴，第1～26天；
丝裂霉素（Mitomycin）10 mg/m2，静滴，第1天；
同步放疗到总剂量36 Gy；
2周后开始以下同步化放疗；
氟尿嘧啶（5-FU）200 mg/m2/天，持续静滴，第1～17天；
丝裂霉素（Mitomycin）10 mg/m2，静滴，第1天；
同步放疗到总剂量23.4 Gy。

肛门癌用以上同步化放疗治疗后大约6周左右，应作活检，如活检发现有残留癌细胞，应作手术切除。

肛门癌如治疗后有局部复发，应作手术切除。

有远处转移的肛门癌不多见，其主要的治疗为化疗。常用的化疗方案为（3）：

氟尿嘧啶（5-FU）1000 mg/m2/天，持续静滴，第1～5天；
顺铂（Cisplatin）100 mg/m2，静滴，第2天；
28天后重复治疗。

癌症的治疗在不断的进步，病人的预后也在不断的改善，由于很多新的治疗尚无对长期生存期影响的具体数据，以下给出的结果是根据现有的统计资料（4），以供参考。

T1：     5年平均生存率为86%，绝大多数病人都会被治愈；
T2：     5年平均生存率为86%，绝大多数病人都会被治愈；
T3：     5年平均生存率为60%，很多病人都会被治愈；
T4：     5年平均生存率为45%，有些病人会被治愈；
N0：    5年平均生存率为76%，多数病人都会被治愈；
N1-3： 5年平均生存率为54%，有些病人会被治愈。